Bên cạnh các CTĐT chính quy lấy bằng đại học của ĐHQGHN, hoặc đồng thời của ĐHQGHN và trường đối tác, Trường Quốc tế còn triển khai các chương trình đào tạo thứ 2 (bằng kép). Sinh viên theo học một ngành đại học chính quy (Ngành 1) tại Trường Quốc tế, Trường Đại học Ngoại Ngữ, Trường Đại học Luật, ĐHQGHN có thể đăng kí học ngành thứ 2 (Ngành 2) trong chương trình của Trường Quốc tế và ngược lại. Sinh viên học bằng kép được miễn một tỉ lệ khá cao các tín chỉ tương đương giữa chương trình Ngành 1 và Ngành 2, cho phép người học tiết kiệm khá nhiều thời gian để có thể nhận được 2 văn bằng tốt nghiệp trong một khoảng thời gian tối ưu nhất có thể. Chi tiết về danh sách các ngành đào tạo thứ 2 và các học phần được công nhận để chuyển đối tín chỉ trong danh sách dưới đây.

I. Ngành thứ 2 học tại Trường Quốc tế

II. Ngành thứ 2 học tại trường Đại học Luật và Đại học Ngoại ngữ

1. Bằng kép cử nhân Luật kinh doanh
2. Bằng kép cử nhân Ngôn ngữ Anh
3. Bằng kép cử nhân Ngôn ngữ Hàn Quốc
4. Bằng kép cử nhân Ngôn ngữ Nhật Bản